Frédéric WIEBER
- Maitre de conférences - Université de Lorraine
- frederic.wieber@univ-lorraine.fr
Domaines de recherche
Histoire de la chimie
Histoire de la biologie
Philosophie de la chimie
Philosophie de la biologie
Publications
Hocquet, A., Wieber, F., Gramelsberger, G., Hinsen, K., Diesmann, M., Pasquini Santos, F., Landström, C., Peters, B., Kasprowicz, D., Borrelli, A., Roth, P. Lee, C. A. L., Olteanu, A., & Böschen, S. (2024). Software in science is ubiquitous yet overlooked. Nature Computational Science, https://doi.org/10.1038/s43588-024-00651-2
Callaerts N., Hocquet A., & Wieber F. (2023). "Conducted Properly, Published Incorrectly": The Evolving Status of Gel Electrophoresis Images Along Instrumental Transformations in Times of Reproducibility Crisis. Berichte zur Wissenschaftsgeschichte, 46(2-3), pp. 233-258, doi.org/10.1002/bewi.202200051
Hocquet A. & Wieber F. (2021). Epistemic Issues in Computational Reproducibility: Software as the Elephant in the Room. European Journal for Philosophy of Science, 11(2), https://doi.org/10.1007/s13194-021-00362-9
Wieber F. & Hocquet A. (2021). A la recherche de flame wars dans une liste de diffusion académique, pp. 293-320 in Ch. Benzitoun et M. Rebuschi (Eds.), Les corpus en sciences humaines et sociales, Nancy: PUN - Editions Universitaires de Lorraine.
Wieber F. & Hocquet A. (2020). Models, Parameterization, and Software: Epistemic Opacity in Computational Chemistry. Perspectives on Science, 28(5), pp. 610-629. https://doi.org/10.1162/posc_a_00352
Wieber F. & Hocquet A. (2020). Méthodes de modélisation en chimie computationnelle : pluralisme et pragmatisme, software et benchmarking, pp. 170-176 in B. Bensaude-Vincent & R.-E. Eastes (Eds.), Philosophie de la Chimie, Paris: De Boeck Supérieur.
Wieber F., Pisanty A. & Hocquet A. (2018). “We were here before the Web and hype…”: a brief history of and tribute to the Computational Chemistry List. Journal of Cheminformatics, 10:67. https://doi.org/10.1186/s13321-018-0322-7
Wieber F. & Hocquet A. (2018). Computational chemistry as “Voodoo Quantum Mechanics”: models, parameterization, and software. ArXiv preprint; http://arxiv.org/abs/1812.00995
Hocquet A. & Wieber F. (2018). Mailing list archives as useful primary sources for historians: looking for flame wars. Internet Histories, 2(1-2), pp. 38-54. https://doi.org/10.1080/24701475.2018.1456741
Hocquet A. & Wieber F. (2017). “Only the Initiates Will Have the Secrets Revealed”: Computational Chemists and the Openness of Scientific Software. IEEE Annals of the History of Computing, 39(4), pp. 40-58. https://doi.org/10.1109/MAHC.2018.1221048
Wieber F. (2014). Contraintes et ressources computationnelles dans l’histoire de la chimie des protéines (1960-1980), pp. 425-452 in F. Varenne, M. Silberstein, S. Dutreuil & Ph. Huneman (Eds.), Modéliser et simuler. Epistémologies et pratiques de la modélisation et de la simulation, Volume 2, Paris: Editions Matériologiques.
Catinaud R. & Wieber F. (2014). Theoretical Artifacts and Theorizing Practices. Commentary on “Chemistry’s Periodic Law: Rethinking Representation and Explanation after the Turn to Practice” by Andrea Woody, pp. 151-160 in L. Soler, S. Zwart, M. Lynch & V. Israël-Jost (Eds.), Science After the Practice Turn in Philosophy, History, and the Social Studies of Science, New York: Routledge.
Soler L. , Wieber F., Allamel-Raffin C., Gangloff J.-L., Dufour C. & Trizio E. (2013). Calibration: a conceptual framework applied to scientific practices which investigate natural phenomena by means of standardized instruments. Journal for General Philosophy of Science 44(2), pp. 263-317.
Wieber F. (2012). Multiple means of determination and mutiple constraints of construction: robustness and strategies for modeling macromolecular objects, pp. 267-288 in L. Soler, E. Trizio, T. Nickles and W. Wimsatt (Eds.), Characterizing the Robustness of the Sciences After the Practical Turn in Philosophy of Science, Boston Studies in the Philosophy of Science Volume 292, Dordrecht: Springer.
Wieber F. (2008). Racines scientifiques de la conception dite rationnelle de médicaments sur ordinateur : pour une histoire de la modélisation (bio)moléculaire. Philosophia Scientiae 12(2), pp. 93-109.
Wieber F. (2006). Interplay between molecular biology and computational chemistry: models and simulations in the construction of a computational protein chemistry (1960-1980), pp. 95-103 in H-J. Rheinberger and S. de Chadarevian (Eds.), History and Epistemology of Molecular Biology, Berlin: Max Planck Institute for History of Science.
Communications
Avec A. Hocquet et N. Callaerts : « “Conducted Properly, Published Incorrectly”: The Evolving Status of Gel Electrophoresis Images Along Instrumental Transformations in Times of Reproducibility Crisis », Conference “Explaining research misconduct: data, hypotheses, and methodological issues”, 6-8 décembre 2023, Nancy.
Avec A. Hocquet : « The subtle impacts of software on trust », SAS23 Conference “Reliability or Trustworthiness”, 30 novembre – 1 décembre 2023, Stuttgart.
Intervenant « Roundtable on the Social Study of Science and Software – Issues, Approaches, Ideas », Workshop “New Horizons in the Social Study of Science and Software”, RWTH Aachen University, 8-9 novembre 2022, Aachen.
Avec A. Hocquet : « Computational Reproducibility and Scientific Software: beyond Code Transparency », Thematic Session “Reproducibility in Computational Practice” (organisée avec H. Hasse, J. Lenhard, G. Gramelsberger et A. Kaminski), Ninth Biennial Conference of the Society for Philosophy of Science in Practice, 2-4 juillet 2022, Ghent.
Avec K. Hinsen et A. Hocquet : « The past, present, and future of reproducible computational research practices », Workshop “Computational Reproducibility and Open Science”, RWTH Aachen University, 23-24 mars 2022, Aachen.
Avec A. Hocquet : « Software as the Elephant in the Room », Workshop “Parameters and Computer Simulations”, RWTH Aachen University, 12-13 janvier 2022, Aachen.
Avec A. Hocquet : « “Only the Initiates Will Have the Secrets Revealed”: Software Packages in Computational Chemistry », Lunchtime lecture at the Science History Institute, 21 Mai 2019, Philadelphie.
Avec A. Hocquet : « 'Only the initiates will have the secrets revealed': computational chemists and the openness of scientific software », 9th Annual SIGCIS Conference "Measure, model, mix: computer as instrument", 29 octobre 2017, Philadelphie.
Avec A. Hocquet : « Looking for flame wars », Society for the History of Technology (SHOT) 2017 Annual Meeting – Panel "Time out of joint", 26-28 octobre 2017, Philadelphie.
Avec A. Hocquet : « ‘Only the initiates will have the secrets revealed': computational chemists and the openness of scientific software », International Society for the Philosophy of Chemistry (ISPC) Annual Conference, 3-6 juillet 2017, Paris.
Avec L. Soler, C. Allamel-Raffin : Symposium « What is Calibration? An Analysis of Calibration Focused on Normal Practices of the Investigation of Nature by Means of Already Standardized Instrumental Devices », colloque « Dimensions of Measurement », 14-16 mars 2013, ZiF Universität Bielefeld, Allemagne.
Avec Régis Catinaud : « Commentary on “The Turn to Practice: Rethinking Representation and Explanation” by Andrea Woody », Colloque Rethinking Science after the Practice Turn, 19-20 juin 2012, Nancy.
Avec L. Soler : « Calibration in everyday scientific practice: a conceptual framework », 14th Congress of Logic, Methodology and Philosophy of Science, 19-26 juillet 2011, Nancy.
Avec L. Soler, C. Allamel-Raffin : « Calibration in everyday scientific practice: a conceptual framework », Society for the Philosophy of Science in Practice (SPSP) third biennial conference, 22-24 juin 2011, Exeter, GB.
« Contraintes et ressources computationnelles dans l’histoire de la chimie des protéines : pratiques de modélisation et collaborations scientifiques autour des ordinateurs », journée d’étude « Des molécules, des hommes et des ordinateurs : introduction et usages de l’informatique dans les sciences biomoléculaires », organisée par J. Pierrel, 31 mars 2011, Laboratoire « Sciences, Philosophie, Humanités », Universités Bordeaux 1 / Bordeaux 3.
« On questions raised by the ‘contingency-inevitability’ debate about the status of historical explanation », Colloque ‘Science as it could have been. Discussing the contingent/inevitable aspects of scientific practices’, organisé par le groupe PratiScienS, 31 août – 5 septembre 2009, fondation « Les Treilles », France.
« Theoretical technologies in an “experimental” setting: empirical modeling of proteinic objects and simulation of their dynamics within scientific collaborations around a supercomputer », Society for the Philosophy of Science in Practice (SPSP) second biennial conference, 18-21 juin 2009, Minneapolis, USA.
« Eléments pour une histoire de la biochimie théorique des protéines : origines et développements de la méthode dite de mécanique moléculaire », XII° congrès annuel de la SHESVIE, 24 mars 2006, Paris.
« Interplay between molecular biology and computational chemistry: models and simulations in the construction of a computational protein chemistry (1960-1980) » : communication (invitée) au workshop ‘History and Epistemology of Molecular Biology and Beyond : Problems and Perspectives’, Max-Planck-Institut für Wissenschaftgeschichte, 13-15 octobre 2005, Berlin.