Le travail éditorial des Archives Poincaré s'oriente dans deux directions principales :
- la direction de la collection Publications des Archives Henri-Poincaré / Publications of the Henri-Poincaré Archives, chez Birkhäuser (dir. G. Heinzmann)
- la publication du périodique Philosophia Scientiæ (dir. M. Rebuschi)
D'autre part, quatre collections sont dirigées par des chercheurs du laboratoire
- Aesthetica (Presses universitaires de Rennes, dir. R. Pouivet)
- Chemins philosophiques (Vrin, dir. R. Pouivet)
- Histoire des institutions scientifiques (Presses Universitaires de Nancy - Editions Universitaires de Lorraine, dir. L. Rollet et M-J. Mailfert)
- Histoires de géométrie (Presses Universitaires de Nancy - Editions Universitaires de Lorraine, dir. P. Nabonnand et D. Flament)
- Philosophie allemande : une autre histoire (Presses Universitaires de Nancy - Editions Universitaires de Lorraine, dir. Ch. Bouriau et Ch. Braverman)